Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSPP1Q1MSJ5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms