Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL24A1Q17RW2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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