Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FXNQ16595 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FXNQ16595 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FXNQ16595 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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