Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SGCAQ16586 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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