Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACKR1Q16570 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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