Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC1Q15915 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC1Q15915 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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