Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRK1Q15835 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GRK1Q15835 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms