Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRNA6Q15825 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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