Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SIX1Q15475 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms