Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABEP1Q15276 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABEP1Q15276 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms