Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCM1Q15154 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCM1Q15154 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms