Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PDK1Q15118 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms