Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRD3Q15059 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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