Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3GAP1Q15042 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3GAP1Q15042 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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