Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERC3Q15034 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERC3Q15034 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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