Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GINS1Q14691 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GINS1Q14691 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms