Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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UBE4AQ14139 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4AQ14139 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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