Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VGLL4Q14135 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VGLL4Q14135 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms