Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CNGB1Q14028 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNGB1Q14028 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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