Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCINQ13939 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCINQ13939 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCINQ13939 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCINQ13939 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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