Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP1Q13835 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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