Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX3Q13761 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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