Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC1Q13547 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDAC1Q13547 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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