Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCGQ13326 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCGQ13326 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms