Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.18e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 STK16-209ENST00000478018 1930 ntTSL 215.33■□□□□ 0.058e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RSRC2-204ENST00000433877 1956 ntTSL 215.07■□□□□ 08e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 STAT2-207ENST00000556539 3278 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.228e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RSRC2-220ENST00000532695 2001 ntTSL 213.22□□□□□ -0.298e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 NFRKB-201ENST00000446488 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.398e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 STK16-204ENST00000409638 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.468e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.548e-12■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 MAPK3-208ENST00000473431 368 ntTSL 210.39□□□□□ -0.753e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RNF10-217ENST00000542701 1388 ntTSL 510.07□□□□□ -0.83e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RNF10-222ENST00000544805 536 ntTSL 29.91□□□□□ -0.823e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RNF10-223ENST00000545419 1336 ntTSL 59.4□□□□□ -0.93e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RNF10-206ENST00000535470 760 ntTSL 38.32□□□□□ -1.083e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RNF10-211ENST00000538254 661 ntTSL 37.67□□□□□ -1.183e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.022e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPL26-210ENST00000584343 747 ntTSL 513.01□□□□□ -0.332e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -12e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.192e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPL26-213ENST00000585176 353 ntTSL 35.94□□□□□ -1.462e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.532e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.652e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 ATXN2-209ENST00000482777 4369 ntTSL 211.81□□□□□ -0.524e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 NDUFV1-208ENST00000526770 1748 ntTSL 520.5■□□□□ 0.873e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.773e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.743e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.623e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.473e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.686e-67■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-8■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 ABHD5-206ENST00000463153 631 ntTSL 211.58□□□□□ -0.564e-7■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 DCXR-204ENST00000577712 429 ntTSL 519.43■□□□□ 0.75e-11■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 MYL4-205ENST00000570772 582 ntTSL 312.13□□□□□ -0.474e-14■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.979e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 PRRC2A-204ENST00000462617 1015 ntTSL 519.66■□□□□ 0.749e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 PRRC2A-214ENST00000492691 1118 ntTSL 214.54□□□□□ -0.089e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.199e-9■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.539e-11■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 217.61■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 FGFR1OP2-202ENST00000327214 2790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 19.6
PABPC4Q13310 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.354e-11■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.334e-11■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 MKNK2-208ENST00000589441 803 ntTSL 515.07■□□□□ 04e-11■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 MKNK2-206ENST00000587416 4093 ntTSL 214.24□□□□□ -0.134e-11■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.344e-11■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.74e-11■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.192e-13■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.842e-13■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.772e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.632e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.428e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 CD81-206ENST00000481386 898 ntTSL 223.15■■□□□ 1.32e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.142e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 CD81-204ENST00000468153 940 ntTSL 221.62■■□□□ 1.052e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC10.23□□□□□ -0.772e-57■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 TMEM141-206ENST00000489739 551 ntTSL 315.01□□□□□ -0.019e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.566e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 NDUFV1-226ENST00000533919 774 ntTSL 317.94■□□□□ 0.463e-9■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-10■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.733e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 AL033504.1-203ENST00000442094 404 ntTSL 33.59□□□□□ -1.833e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 SUPT5H-218ENST00000600818 718 ntTSL 216.2■□□□□ 0.184e-10■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 SUPT5H-203ENST00000402194 3698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.374e-10■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.394e-10■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 SUPT5H-204ENST00000432763 3710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-10■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 SUPT5H-215ENST00000599117 3902 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.434e-10■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 SUPT5H-213ENST00000598725 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-10■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.484e-14■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.493e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.444e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 321.86■■□□□ 1.094e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.054e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.835e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 LRP10-202ENST00000470660 486 ntTSL 319.2■□□□□ 0.663e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 ULK3-212ENST00000566479 2715 ntTSL 1 (best)19.17■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 ULK3-222ENST00000570276 2951 ntTSL 1 (best)18.57■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.555e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.43e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.373e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GTF2A2-210ENST00000559706 382 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 ULK3-202ENST00000561725 2738 ntTSL 516.38■□□□□ 0.215e-7■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 LRP10-204ENST00000551466 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.1■□□□□ 0.013e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 GTF2A2-209ENST00000559141 293 ntTSL 514.27□□□□□ -0.133e-15■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.088e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.328e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.368e-8■■■■□ 19.5
PABPC4Q13310 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 517.67■□□□□ 0.422e-8■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 211.86□□□□□ -0.514e-16■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.862e-9■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-9■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.271e-6■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 C14orf166-207ENST00000557553 557 ntTSL 416.91■□□□□ 0.31e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 C14orf166-206ENST00000556760 851 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-7■■■■□ 19.4
PABPC4Q13310 C14orf166-202ENST00000553362 683 ntTSL 26.61□□□□□ -1.351e-7■■■■□ 19.4
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 110.8 ms