Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPA4Q13156 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPA4Q13156 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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