Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RESTQ13127 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RESTQ13127 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RESTQ13127 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RESTQ13127 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RESTQ13127 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RESTQ13127 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RESTQ13127 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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RESTQ13127 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RESTQ13127 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms