Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
PRDM2Q13029 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
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