Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BNIP3Q12983 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BNIP3Q12983 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms