Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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FOXD4Q12950 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
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FOXD4Q12950 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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FOXD4Q12950 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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FOXD4Q12950 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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FOXD4Q12950 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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FOXD4Q12950 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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FOXD4Q12950 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXD4Q12950 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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