Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN13Q12923 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN13Q12923 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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