Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TP53BP1Q12888 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TP53BP1Q12888 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TP53BP1Q12888 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TP53BP1Q12888 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TP53BP1Q12888 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TP53BP1Q12888 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TP53BP1Q12888 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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TP53BP1Q12888 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TP53BP1Q12888 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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