Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms