Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NIPAL4Q0D2K0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms