Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDE4CQ08493 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDE4CQ08493 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms