Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPN11Q06124 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN11Q06124 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms