Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ACVR1Q04771 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ACVR1Q04771 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms