Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMX2Q04743 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms