Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CYP4A11Q02928 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYP4A11Q02928 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms