Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPIBQ01892 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPIBQ01892 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms