Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF2Q01130 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms