Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F1Q01094 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms