Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD1P98174 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD1P98174 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms