Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX6P78412 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX6P78412 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRX6P78412 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRX6P78412 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRX6P78412 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
IRX6P78412 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX6P78412 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX6P78412 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms