Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKP1P63208 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms