Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA2P62736 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms