Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACTBP60709 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTBP60709 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTBP60709 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms