Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB38P57729 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB38P57729 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB38P57729 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB38P57729 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB38P57729 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB38P57729 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB38P57729 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB38P57729 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms