Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EPHB4P54760 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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