Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AP2S1P53680 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms